学校于2021年9月推动与湖州市农业农村局合作共建校级研究机构城乡共同富裕研究中心，2024年7月在原有“中心”基础上成立中国式现代化乡村发展研究院，入选2024年度浙江省乡村振兴研究智库联盟成员单位。
研究院紧扣“湖州学院姓湖州、湖州学院兴湖州”办学使命，聚焦高水平应用型大学办学定位，整合全校研究资源力量，积极服务湖州市缩小城乡差距领域共同富裕省级试点建设，与湖州市农业农村局、安吉县孝丰镇等部门单位合作共建研究中心，协同开展年度课题研究，近3年共完成年度课题20余项，撰写研究报告20余篇，其中2篇研究报告分别获得2024年浙江省农业农村系统优秀调研报告评选二等奖、浙江省乡村振兴战略研讨会征文活动一等奖；2项研究报告获中央部委采纳，1项获浙江省领导批示，2项获市领导批示。成员获省部级课题10项，市厅级课题18项，横向项目24项，获批经费240余万元。在《中国社会科学报》《中国教育报》《浙江日报》等重要报刊发表论文23篇。与湖州市农业农村局合作编写《聚焦绿色共富以乡村集成改革推动城乡均衡发展省级共富试点成果集》（验收版）、《湖州市乡村集成改革推动城乡融合发展》、《湖州市乡村运营发展的理论演进与实践模式》。